El MUNTREF abrió sus puertas al público en el año 2002 con el objetivo de construir un espacio abierto para las artes y al servicio de la comunidad. Arte para Todos es el lema desde el que se despliega en cada muestra un vasto programa de actividades destinadas a diferentes públicos, con particular atención al programa educativo para escuelas.
El museo es un puente capaz de hacer circular socialmente las investigaciones sobre arte y artistas argentinos, latinoamericanos y también de aquellos referentes del movimiento moderno y contemporáneo internacional. Por esta razón, funciona además como espacio de encuentro, desarrollo y experimentación para distintas áreas de la universidad: Gestión del Arte y la Cultura, Artes Electrónicas, Ingeniería de Sonido, Historia y la Maestría en Curaduría en Artes Visuales, entre otras.
Además de las muestras de grandes maestros del arte moderno argentino e internacional que el MUNTREF ofrece desde hace años en su sede original del campus de Caseros, ahora agrega toda la compleja trama de soporte y diversidad de expresiones de lo más representativo del arte contemporáneo desde sus cuatro sedes: El Museo de Artes Visuales, el Centro de Arte Contemporáneo, Museo de la Inmigración, y Arte y Ciencia.